मायोमेक्टोमी एक शल्य प्रक्रिया है जिसमें गर्भाशय के स्थान पर केवल फाइब्रॉएड को हटाया जाता है। यह गर्भधारण की सम्भावना को बरकरार रखता है। मायोमेक्टोमी गर्भाशय के भीतर फाइब्रॉएड के स्थान के आधार पर अलग-अलग तरीकों से किया जा सकता है। सबसे आम तरीका पेट की मायोमेक्टोमी है, जिसमे सर्जन एक पेट के चीरे के माध्यम से गर्भाशय फाइब्रॉएड की परिकल्पना करता है। कुछ परिस्थितियों में, मायोमेक्टोमी करने के लिए अन्य तरीकों का इस्तेमाल किया जा सकता है। सबम्यूकोसल फाइब्रॉएड तक हिस्ट्रोस्कोपिक मायोमेक्टोमी से पहुंचा जा सकता है। इस दृष्टिकोण में फाइब्रॉएड का री-सेक्शन करने के लिए योनि के माध्यम से एक कैमरा गर्भाशय में डाला जाता है। सब्सीरोसल फाइब्रॉएड, गर्भाशय के बाहरी कवर के नीचे, लेप्रोस्कोपिक मायोमेक्टोमी की सहायता से सबसे अच्छे तरीके से ठीक किये जा सकते हैं, जिसमे एक छोटे से कैमरे का पहचान करने और फाइब्रॉएड को दूर करने में सहायता करने के लिए उदर गुहा में डालकर उपयोग किया जाता है।

हालांकि यह प्रक्रिया लक्षणों में कमी प्रदान करती है और ज्यादातर महिलाओं में अत्यधिक एवं लंबे समय तक के माहवारी रक्तस्राव को कम करती है, वहाँ फाइब्रॉएड पुनरावृत्ति का एक छोटा सा जोखिम भी है। लगभग 10% महिलाओं को नए फाइब्रॉएड के भविष्य में विकास के कारण अतिरिक्त ऑपरेशन की आवश्यकता हो सकती है।