एक थोरैकोस्कोपिक प्रक्रिया के साथ जुड़े जोखिम में शामिल हैं:
●    अत्यधिक रक्तस्राव
●    सामान्य एनेस्थीसिया के जोखिम जिसे प्रक्रिया में प्रयोग किया जाता है
●    संक्रमण
●    न्यूमोथोरैक्स, एक ऐसी स्थिति जिसमे फेफड़ों से प्ल्यूरल गुहा में हवा का रिसाव होता है, जिससे अक्सर फेफड़ों का पतन हो सकता है 
●    डायाफ्राम के छिद्र