VATS ऑपरेटिंग थिएटर में किया जाता है। प्रक्रिया से पहले, एक छोटी सी सुई को तरल पदार्थ और दवाऐं देने के लिए नस में रखा जाएगा। यह आमतौर पर यह एक सामान्य एनेस्थीसिया से किया जाता है, अर्थात आप सर्जरी के दौरान सो रहे होंगे। आपको एक एपीड्यूरल भी दिया जा सकता है। एक एपीड्यूरल आपकी पीठ में रखी एक पतली ट्यूब के माध्यम से दिया जाने वाला दर्द निवारक है। जब आप सो रहे हैं, तब आपके मूत्राशय में एक कैथेटर डाला जा सकता है। यह एक पतली, लचीली ट्यूब है जिसे आपके पेशाब करने के छेद (आपके मूत्रमार्ग) के माध्यम से मूत्राशय में डाला जाता है। इसका कारण यह है कि एपीड्यूरल आपके लिए स्वयं पेशाब करना मुश्किल कर देता है। यह डॉक्टरों द्वारा आपके मूत्र को मापने के लिए भी इस्तेमाल किया जाता है। आपको पक्ष पर ऑपरेटिंग मेज पर रखा जाएगा। आपका सर्जन आपके सीने में कट (चीरे) बनाएगा और थोरैकोस्कोप और अन्य ज़रूरी उपकरण डालेगा। सर्जरी समाप्त होने के बाद वह सीने में कुछ छोटी ट्यूबें डालेगा। इन्हें छाती नालियों के नाम से जाना जाता है और ये किसी भी इकठ्ठा हुए तरल पदार्थ या हवा को बाहर की ओर निकालती है। अपने सीने या फेफड़ों से लिए गए टिश्यू के सभी नमूने आगे की जांच के लिए प्रयोगशाला में भेज दिए जायेंगे।

आपको धीरे-धीरे एनेस्थेटिक से बाहर आने के लिए अनुमति दी जाएगी। आम तौर पर आपको एक मास्क के माध्यम से ऑक्सीजन दी जाती है। कुछ समय बाद आपको आराम करने के लिए वापस वार्ड में ले जाया जाएगा। एपीड्यूरल आम तौर पर तब तक रहता है जब तक सीने में से नालियों को बाहर निकाला जाता है और आप दर्द से राहत की गोलियां लेने के लिए सक्षम हो जाते हैं। यदि VATS का उपयोग करने की योजना बनाई भी जाये, तब भी कीहोल सर्जरी के माध्यम से ऑपरेशन करना मुमकिन नहीं होता है। अर्थात एक और तकनीक का इस्तेमाल किया जाना पड़ सकता है। आपके डॉक्टर को प्रक्रिया से पहले आप के साथ इस पर चर्चा करनी चाहिए।